Elle assure le diagnostic bactériologique de routine pour les malades des services hospitaliers mais aussi pour les patients consultant à titre externe en réalisant la recherche de pathogènes par des techniques de culture et des techniques antigéniques. Le diagnostic de la tuberculose est réalisé par la microscopie, la culture et les techniques moléculaires pour le dépistage de la tuberculose multi-résistante. Elle participe à la formation des étudiants en pharmacie, des masters en sciences, des techniciens de laboratoires, et de thésards de divers horizons. Cette unité bénéficie d’un accompagnement de ASLM pour la qualité.